AI自主科研新突破:Ginkgo携手OpenAI打造GPT-5智能实验平台
Ginkgo Bioworks与OpenAI携手取得突破性进展,共同打造了一套AI驱动的全自动实验平台,可独立完成生物实验的设计、执行与结果分析,几乎无需人工介入。根据最新公布的预印本研究成果,该平台使无细胞蛋白合成反应的成本下降了40%,并在六轮迭代中测试了36,000种不同的实验条件。
这项创新性研究将OpenAI的GPT-5推理模型与Ginkgo自有的云实验室基础设施——包括可重构自动化模块(RAC)和Catalyst自动化软件——进行了深度整合。这种融合让AI得以通过闭环迭代机制完成实验的设计、执行与分析。GPT-5利用网络资源、数据分析计算机及历史实验信息,充当了实验科学家的角色。在半年内,它研发出了比现有文献记录更具成本优势的无细胞蛋白合成方案。
Ginkgo与OpenAI联合发表论文
“通过融合先进的大语言模型与自动化实验平台,我们发现的反应配方比现有最佳方案更具成本效益,”Ginkgo Bioworks联合创始人、本研究共同作者Reshma Shetty表示。“我们预期未来自动化实验室将承担更多实验任务,届时试剂和耗材费用将成为主要支出。蛋白合成成本的降低意味着可进行更多实验,使科研投入产生更大价值。”
该自动化平台成功制备了标准参照蛋白超折叠绿色荧光蛋白(sfGFP),其反应成分总成本为每克422美元,远低于此前698美元/克的纪录,成本削减达40%。无细胞蛋白合成一直受困于高昂的材料费用和复杂的优化流程,这令其成为验证自动化实验技术的理想对象。
“对OpenAI而言,这是首次以前沿AI模型对接自动化实验室并开展大规模实验,”OpenAI生命科学研究主管、本研究共同通讯作者Joy Jiao指出。“这一成果证明AI系统可深度整合到实验流程中,协助提出假设、验证假设,并根据真实数据实现迭代改进。”
Ginkgo Bioworks波士顿自动化云实验室
实验期间,自动化平台完成了580余块384孔板的操作,对36,000种反应配方进行了测试,产出近15万组实验数据。人工干预仅限于试剂准备、系统监测和物料装卸,而GPT-5驱动的实验室自动完成了实验设计、执行、数据解析和假设构建等关键环节。引人注目的是,AI自主识别并优先验证了新型试剂组合,部分结果与未接受过训练的已发表文献结论一致。
为防止AI生成不可行或无效的实验设计,所有方案在执行前均需通过Pydantic模型验证,涵盖孔板布局、标准品配置、对照设计、重复次数、试剂存量及体积约束。仅通过验证的方案才会被执行,系统还会依据科学严谨度和历史数据对方案评分,优中选优。GPT-5同时会生成可读的实验日志,详尽记录分析流程、观察发现与决策依据,保障全流程的可追溯性。
“这标志着AI正在从事真正的实验科学研究:设计、执行并从结果中汲取经验,”Ginkgo Bioworks联合创始人兼CEO Jason Kelly强调。“AI与自动化实验室的融合是美国保持全球科技竞争力的核心能力——美国能源部刚发布的'Genesis Mission'正是将AI应用于科学前沿的典范,我们与OpenAI的合作验证了这一路径的可行性。”
Pydantic验证模型将开源发布,AI优化的无细胞反应试剂盒已在Ginkgo试剂商店上架销售。完整研究预印本可在OpenAI官网查看,并将很快提交至bioRxiv平台。该研究尚待同行评议。
原文地址: https://www.prnewswire.com/news-releases/ginkgo-bioworks-autonomous-laboratory-driven-by-openais-gpt-5-achieves-40-improvement-over-state-of-the-art-scientific-benchmark-302680619.html