专访聂再清：水木分子用“AI+管线”跑出双轮进化

人工智能正在与生物医药领域深度耦合，进而改变全球制药行业的创新逻辑与增长路径。

艾媒咨询的数据显示，预计到2026年全球AI制药市场规模将达到29.9亿美元；其中中国市场的推进速度更快，2020年至2025年间五年规模增幅超过7倍。

行业热度并非凭空而来。在2026年初的JPMorgan大会上，跨国药企与英伟达等科技巨头的合作接连落地；与此同时，国内头部药企的BD交易和出海行动持续加码，AI也正成为继生物药之后，中国生物医药“出海”的另一张关键名片。

在这轮变革浪潮中，清华大学智能产业研究院（AIR）孵化的水木分子，依托ChatDD智能体框架、OpenBioMed开源平台，以及水木知了面向C端的生命科学“超级大脑”工具和多模态大模型等成果，走出“工具赋能+管线自研”的双轮驱动路线，成为AI制药方向值得关注的成长型企业。

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清华AIR孵化+前阿里AI大牛掌舵

清华大学万国数据教授、AIR首席研究员聂再清教授担任公司首席科学家

水木分子的起步，与清华大学智能产业研究院（AIR）的科研土壤和核心团队的持续积累密不可分。

水木分子成立于2023年6月，由张亚勤院士创办的清华大学智能产业研究院（AIR）孵化而来，目标是面向生命科学打造基础大模型与智能体平台。公司的关键人物——发起人兼首席科学家聂再清教授，是清华大学万国数据教授、AIR首席研究员，并担任“十四五”国家重点研发计划BTIT融合项目中“新药研发大模型方向”的课题负责人。

在进入清华之前，聂再清教授曾在微软亚洲研究院担任首席研究员，负责微软学术搜索以及自然语言理解平台LUIS相关技术；随后加入阿里巴巴，担任人工智能实验室北京负责人，同时担任天猫精灵首席科学家，主导天猫精灵战略级智能助手项目的研发工作。

2020年，聂再清教授应邀加入清华大学智能产业研究院，团队的视野也由产业通用方向转向生物医药，“我们当时判断，这一轮大模型的技术跃迁影响深远，甚至不小于我们经历过的任何一次工业革命。每个行业都会被大模型和智能体技术重塑，而生物医药行业是最适合率先切入的方向。”

聂再清教授进一步阐释，“该行业沉淀了海量的专属数据，尤其是蛋白质相关信息，它们拥有独特的‘语言’与‘语法’——氨基酸序列会直接影响蛋白质的结构与功能。这使得我们有机会构建不同于通用大模型的多模态大模型与产品，真正对准行业痛点，实现自然语言与蛋白质语言的跨模态转换，让AI更好地落到生物科研创新的需求上。”

基于这样的判断，水木分子将“蛋白质语言+自然语言”的多模态理解能力作为关键切入点，进入AI制药赛道。公司目前汇聚了包括聂再清教授在内的国际顶尖专家力量，搭建覆盖科研、工程化与商业化的复合团队——张亚勤院士、马维英教授担任联合发起人；前药明康德副总裁邢杰出任首席运营官；前Pathos高级副总裁潘琦博士担任生物医药首席科学家，形成“AI技术+药研经验”的双核心竞争优势。

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水木分子正在成为AI大模型赋能的药物研发创新企业

随着潘琦博士加盟——这位拥有二十余年贯通靶点发现、药物研发、临床转化及战略合作的端到端经验，是国际生物医药领域资深的研发与管理专家——水木分子迎来关键角色。潘琦博士出任生物医药首席科学家（Chief Scientific Officer, Biopharmaceuticals）。她将全面统筹公司生物医药与ChatDD（AI智能体驱动的人机协作药物研发）的科研战略，负责研发体系建设、AI药物管线推进以及全球合作布局，并组建团队实现干湿实验的闭环，为水木分子的长期能力与持续增长注入核心动力。

在管线推进上，水木分子从自身免疫领域的适应症入手搭建第一条自研管线。团队选择了一类由复杂多通路网络共同调控的自身免疫性疾病：现有疗法多聚焦单一靶点，疗效与覆盖面存在局限。基于ChatDD-Insight对致病机制的系统性解析，团队决定用人工智能设计双特异性抗体，同时同时干预两条核心信号通路。目前，依托ChatDD-Discovery平台的计算设计工作已完成，产出多款表现优异的候选分子；后续将继续推进湿实验与临床前验证。

在推进管线的同时，水木分子也同步搭建两项关键能力：其一是面向双特异性抗体的AI驱动设计平台；其二是针对自身免疫疾病的双靶点组合洞察与验证体系。

未来，水木分子计划将上述能力延展至肿瘤与更多疾病方向，以更高速度与系统化方式借助人工智能打造创新药物管线矩阵。

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双端产品爆发：OpenBioMed开源破局，大模型产品水木知了普惠行业

在核心团队的带动下，水木分子自成立以来发展迅速，阶段性成果持续涌现。公司已推出全球首个生物医药研发智能体ChatDD、首个多模态开源版大模型BioMedGPT，以及商业版大模型ChatDDFM®。根据水木分子披露，目前公司已与30+知名品牌达成合作，2025年全年订单金额同比增速超过100%，储备客户数量超过100家。

这种上行趋势也在2026年延续。近期，水木分子的产品矩阵再次迎来关键升级：B端开源平台OpenBioMed Skills正式上线；C端切入的行业大模型产品水木知了®开启公测。该“双赋能”策略意味着水木分子已形成“B端服务专业研发、C端覆盖行业人群”的双产品结构，公司正从技术验证迈向生态构建的新阶段。

■ 堪比生物医药领域的「AI 龙虾」爆款应用OpenBioMed Skills

“如果要做生物医药版的‘小龙虾’，最缺的不是工具，而是生物医药的专业技能。”OpenBioMed Skills正是基于这一思路打造。其底层逻辑来自聂再清教授团队对药物研发痛点的长期观察：“在传统药研流程中，许多环节往往只能依赖经验丰富的专家；而现有通用Skill库通常只是对工具使用文档做简单封装，难以真正解决复杂的科研问题。”

OpenBioMed Skills的关键突破，是把分散在学术期刊、工具说明与专家经验中的知识，系统沉淀为可共享、可迭代的技能库。研究人员无需具备深厚编程基础，只要通过自然语言对话就能搭建并运行端到端的药研工作流。首批发布的45项精选技能被划分为5大类，覆盖生物化学/药物研发、蛋白质分析与设计、单细胞组学分析，同时也提供数据检索、工具调用等辅助能力。

Skills架构图，图源水木分子

与市场上常见的通用Skill库相比，OpenBioMed Skills体现出更突出的差异化优势。它强调长线工作流设计，能够支持多工具协作、端到端执行，并在过程中进行实时反馈与调整。同时，它引入人机协作机制，将专家知识与决策逻辑集成到AI技能之中，形成“专家大脑的数字分身”。产品内置领域解读框架，可将专业数据放入行业语境完成解释，“就像生物医药版OpenClaw”。此外，系统支持完全本地化部署，数据处理与模型推理均在用户私有环境中完成，目标是从源头降低数据泄露风险。

聂再清教授表示，“OpenBioMed Skills的推出，意味着生物医药AI正在从‘工具可以用’走向‘专家能力可复用’的范式转变。”

目前，OpenBioMed Skills已部署到OpenBioMed平台，可直接调用PharMolixFM、BioMedGPT-R1、MutaPLM等自研多模态模型。代码已在GitHub开源，专家可通过飞书、钉钉、微信远程指挥生物医药Agent完成任务。

■ “AI生命科学情报助手”水木知了

在B端开源产品持续推进的同时，水木分子的C端产品“水木知了”也已正式进入公测。该产品源自内部的ChatDD-Insight模型，聚焦生命科学领域的情报解读与知识普惠，旨在填补C端专业生命科学AI工具的市场空白。

生命科研领域每天都会产生大量情报信息，例如新的技术平台、AI模型、靶点与临床前药物研发进展、临床实验更新、医疗器械、生物制造、管线交易、融资信息等。水木知了将持续运转，为每位用户做个性化筛选，自动剔除重复与泛泛而谈的无效噪音，只把真正高价值的内容推送到用户视野中。用户无需再在海量信息中耗费精力，信息筛选效率可直接提升10倍。

与此同时，水木知了基于ChatDDFM®系列模型，可根据用户不同的认知阶段提供分层服务：面向行业“小白”用更通俗的方式解释专业概念；为具备一定经验的研究者给出深度但易懂的解读；对专家级用户开放权威知识图谱，支持更深层次的交流与AI咨询。

“水木知了更像是一个‘情报助手’，”聂再清教授介绍，“它既能解读当天发表的论文和行业动态，也能回答用户的具体问题。我们把药物研发领域常见的专业黑话、行业术语与复杂机制，用更易理解的方式呈现给用户。产品提供深度思考模式、自动决策模式以及‘小红书’风格模式，希望既能提升科研人员的信息获取效率，也能推动生物医药知识普惠，把原本只属于‘炼丹老法师’的知识实现‘平权化’。”

此外，该产品目前完全免费。不过也不排除在未来推出深度报告、专业咨询等更重GPU资源消耗的场景时进行相应收费；同时，B端客户还可以选择内部部署专业版水木知了，进一步扩大产品覆盖范围。

依托上述产品，水木分子已在合作生态层面与数十家头部生物医药企业、医院及科研机构建立深度协作，形成“技术输出+合作研发”的多元化商业模式。

在出海布局方面，水木分子已启动规划，整体分为工具出海与管线出海两条路径。目前公司在工具出海方向已形成合作，并在东亚市场取得初步进展，后续将逐步拓展到更广阔的全球市场。

当AI真正成为科研工作者的通用工具，生物医药科研的关键拐点或将加速到来。水木分子的探索，正是这场变化的缩影：它并不是为了替代专家，而是借助智能体把专家的经验与直觉实现规模化复用；它也不是闭门造车，而是通过开源生态把最前沿的AI能力变成行业基础设施。从清华实验室到产业一线，从代码开源到管线自建，水木分子的故事仍在持续推进。

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