Illumina发布StrataMap芯片，精准绘制组织基因三维图谱

基因测序巨头Illumina Inc.（纳斯达克代码：ILMN）今日正式发布StrataMap空间解决方案。作为一款端到端的基于测序技术的空间转录组学平台，它致力于以前所未有的广度和分辨率，革新研究人员在空间维度上探索全转录组数据的能力。

StrataMap空间解决方案（原名Illumina空间解决方案）提供了一套集成化的完整工作流。科学家可在单细胞分辨率下，对7.5平方厘米内的组织切片进行无偏倚的全转录组分析。相较于基于探针panel的技术，StrataMap的测序方法能检测的基因数量翻倍，并能挖掘出非编码基因和假基因中的潜在信号。

该平台在通量、速度及可及性方面树立了新标杆。StrataMap每年可处理超2000个样本，最快22小时完成测序，全流程可在五天内产出数据洞察。此外，它能无缝融入现有组织病理学流程，并在NovaSeq和NextSeq平台上运行，为用户进入空间生物学领域提供了便捷通道。

生物信息学支持上，StrataMap搭载DRAGEN和Illumina Connected Multiomics软件。DRAGEN StrataMap流程利用机器学习进行细胞分割和转录本分配，简化空间探索；Connected Multiomics平台则通过交互式数据分析，支持将转录组与基因组、表观组及蛋白质组数据进行整合。

早期试用该平台的研究团队已取得显著成果。贝斯以色列女执事医疗中心（BIDMC）团队利用StrataMap绘制了人类淋巴集合管图谱并构建了3D模型。英国癌症研究剑桥研究所及剑桥大学团队则在原发性中枢神经系统肿瘤测试中取得成功，覆盖胶质瘤和胶质母细胞瘤，为精准手术和个性化治疗提供了新方向。

StrataMap空间解决方案本月起正式开放订购，主要面向发育生物学、神经科学和肿瘤学领域。当前支持新鲜冷冻组织样本（适用于真核生物）。此外，Illumina正开发适用于FFPE组织的特异性解决方案，预计2027年面向首批客户开放。

责任编辑：张俊 SF065

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