时空日报 110 期：AI 病理助力肝癌治疗及多项前沿组学研究
各位读者好，欢迎来到《时空日报》第 110 期。本期精选了 5 篇与时空技术及细胞组学紧密相关的学术文献。以下内容基于时空云平台 STOmics Cloud 的 StereoCopilot 模块自动生成概要，并经过人工复核，供您阅览参考。
1
AI 病理学作为肝细胞癌患者阿替利珠单抗联合贝伐珠单抗疗效的生物标志物：多中心回顾性分析
Artificial intelligence-based pathology as a biomarker of sensitivity to atezolizumab-bevacizumab in patients with hepatocellular carcinoma: a multicentre retrospective study
The Lancet. Oncology; IF:51.100; DOI: 10.1016/S1470-2045(23)00468-0
核心摘要：
① 这项多中心回顾性研究分析了 840 位肝细胞癌患者的数据。结果显示，在 122 名接受阿替利珠单抗联合贝伐珠单抗治疗的患者中，那些阿替利珠单抗 - 贝伐珠单抗反应特征预测（ABRS-P）得分较高的患者，其治疗启动后的无进展生存期显著优于低分患者。
② 空间转录组学数据揭示，相较于 ABRS-P 低值区域，高值肿瘤区域表现出显著更高的 ABRS 评分，并伴随多种免疫效应分子的上调表达。
③ 研究证实，应用于肝癌数字切片的人工智能技术，可作为预测患者接受阿替利珠单抗 - 贝伐珠单抗治疗后无进展生存期的生物标志物，有助于开发低成本、高效率的靶向治疗方案。
④ 将人工智能生成的热图与空间转录组学数据融合，能深入解析与疗效预测相关的分子特征。该策略可推广至其他癌症或疾病研究，深化人们对驱动治疗反应生物机制的理解。
基于空间转录组学评估的 ABRS 评分热图
疾病研究；肝细胞癌，阿替利珠单抗 - 贝伐珠单抗，生物标志物，人工智能，空间转录组；Qinghe Zeng, Julien Calderaro; Université Paris Cité; France.
2
离散型“早期应答”基质细胞亚群调控免疫细胞向受损组织的募集
A discrete 'early-responder' stromal-cell subtype orchestrates immunocyte recruitment to injured tissue
Nature Immunology; IF:30.500; DOI: 10.1038/s41590-023-01669-w
核心摘要：
① 通过对急性损伤后不同时间点的肌肉间充质基质细胞（MmSCs）进行 scRNA-seq 分析，研究人员发现了一种“早期应答”细胞亚型。该亚型在损伤第 1 天即出现，并表达一系列编码免疫调节功能的转录本。
② 将携带独特表面标记的炎症性 MmSC 亚型移植到健康后肢肌肉中，会诱发主要由中性粒细胞和巨噬细胞介导的炎症反应。
③ 在该亚型产生的大量炎症转录本中，Cxcl5 表现出肢体特异性，且在损伤时大幅上调。若在损伤早期阻断这种趋化因子，将严重影响中性粒细胞的招募，延长炎症持续时间并阻碍组织再生。
④ 在肌肉萎缩症小鼠模型以及人与小鼠的其他多种组织和病理状态下，均发现了表达类似炎症程序的间充质基质细胞亚型。这些预存的“早期应答”细胞能够迅速、协调地动员并扩增关键的细胞协作者，以应对组织损伤。
小鼠后肢 MmSCs 在不同时间点的 UMAP 可视化图谱
疾病研究；小鼠，急性损伤，间充质基质细胞，炎症，趋化因子，scRNA-seq；Omar K Yaghi, Bola S Hanna, Diane Mathis; Harvard Medical School, Harvard Medical School and Brigham and Women's Hospital; USA.
3
人多能干细胞定向分化为关节软骨揭示 WISP3 基因缺失对儿童进行性假性类风湿性关节炎的影响
Directed differentiation of human pluripotent stem cells into articular cartilage reveals effects caused by absence of WISP3, the gene responsible for progressive pseudorheumatoid arthropathy of childhood
Annals of the Rheumatic Diseases; IF:27.400; DOI: 10.1136/ard-2023-224304
核心摘要：
① 研究人员利用两名进行性假性类风湿性关节炎（PPAC）患儿的诱导性多能干细胞（iPSCs），以及一个敲除了 WNT1 诱导信号通路相关蛋白 3（WISP3）的人类胚胎干细胞系，成功构建了关节软骨样组织。通过 scRNA-seq 和原位杂交等技术，将这些组织与两个 WISP3 高表达的同源对照系进行了体外对比分析。