深度学习赋能蛋白质设计：系统化实战课程

蛋白质设计核心技术

Frontier technologies in protein design

当前，人工智能正在深刻重塑蛋白质设计领域。以AlphaFold、ESM、RFdiffusion等为代表的AI系统，使得从零开始构建具有新颖结构和特定功能的蛋白质成为现实，为创新药物研发、工业酶改造等行业开辟了全新路径。然而，先进工具的普及也伴随着新的障碍：繁复的软件环境搭建、多元的模型调用方法以及从“构思”到“成果”的全流程整合，对广大科研人员特别是入门者而言仍是实际困难。

本培训课程致力于系统性地攻克这些难题。课程从Linux操作系统与Conda环境配置的基础知识入手，帮助每位学员构建稳定且可重现的计算环境。核心内容将深入演练三大前沿技术：运用ESM模型执行序列分析与特征提取；熟练运用ProteinMPNN为指定骨架设计最优序列；通过RFdiffusion完成从无到有的蛋白质骨架构建。最终，通过“设计靶向EGFR的新型结合蛋白”这一综合案例，串联全部技术要点，引导学员完整经历靶标分析、骨架构建、序列优化到AI结构验证的全流程，高效掌握独立开展蛋白质设计项目的核心能力。

培训安排

课程形式

l基础理论、技术实践、案例剖析、现场答疑

l完成全部课程者将获颁结业证书